Untersuchungsmaterial:

• Die genetischen Untersuchungen werden an formalinfixierten paraffineingebetteten (FFPE) Material durchgeführt. Wir arbeiten sowohl Paraffinblöcke als auch Leerschnitte auf, die uns von pathologischen Instituten zugesandt werden, welche die Primärdiagnostik durchgeführt haben.  Aufgrund des Hämatoxylin-Eosin Schnittes wird der Tumorgehalt bestimmt und davon abhängig die Probe einer Mikrodissektion unterzogen.
• In Kürze werden wir die tumorgenetischen Untersuchungen zellfreier DNA aus Blutproben anbieten.

DNA und RNA Extraktionen (Vollautomatisch und manuell):

• Maxwell® RSC Instrument (Vollautomatisch)
• Qiagen Extraktions Kits (Manuell)

DNA und RNA Konzentrationsbestimmung

• Qubit™4 (Fluorometrische Bestimmung)
• Tapestation 4150 von Agilent Technologies (Elektrophoretische Bestimmung)

Unser Ziel ist es, die Befundlaufzeiten durch Optimierung der internen Abläufe sehr kurz zu halten. Nach der Umstellung unserer Plattform auf  Thermo Fisher Geräte (2020) bieten wir aktuell folgende Laufzeiten an (je nach Analyse):

Reguläre Bearbeitung:

• 3 Werktage (Idylla)
  • BRAF, EGFR, KRAS, NRAS, MSI
• 6 Werktage (Next generation sequencing – NGS)
  • BRCA1/2, EGFR, KIT, Multi-Gen Panel für Lungenkarzinome, MGMT Methylierung,
    MLH1 Methylierung, Multi-Gen Panel solider Tumoren, PIK3CA, PDGFRα

Eilige Fälle (beschleunigte Bearbeitung):

• 1 Werktag (Idylla)
  • BRAF, EGFR, KRAS, NRAS, MSI
• 3 Werktage (Next generation sequencing – NGS)
  • BRCA1/2, EGFR, KIT, Multi-Gen Panel für Lungenkarzinome, MGMT Methylierung,
    MLH1 Methylierung, Multi-Gen Panel solider Tumoren, PIK3CA, PDGFRα